蛋白質(zhì)相互作用(PPI)是兩個(gè)或多個(gè)蛋白質(zhì)分子之間建立的高度特異性的物理接觸，這是由靜電力、氫鍵和疏水效應(yīng)等相互作用引導(dǎo)的生化事件的結(jié)果。許多是與特定生物分子環(huán)境中細(xì)胞或活生物體中發(fā)生的鏈之間的分子關(guān)聯(lián)的物理接觸。 蛋白質(zhì)很少單獨(dú)行動(dòng)，因?yàn)樗鼈兊墓δ芡艿秸{(diào)節(jié)。細(xì)胞內(nèi)的許多分子過程都是由分子機(jī)器執(zhí)行的，這些分子機(jī)器由許多由其PPI組織的蛋白質(zhì)成分構(gòu)建而成。這些生理相互作用構(gòu)成了所謂的生物體相互作...

蛋白質(zhì)交互作用 

    蛋白質(zhì)相互作用 (PPI) 是兩個(gè)或多個(gè)蛋白質(zhì)分子之間建立的高度特異性的物理接觸，這是由靜電力、氫鍵和疏水效應(yīng)等 相互作用引導(dǎo)的生化事件的結(jié)果。 許多是與特定生物分子環(huán)境中細(xì)胞或活生物體中發(fā)生的鏈之間的分子關(guān)聯(lián)的物理接觸。

    蛋白質(zhì)很少單獨(dú)行動(dòng)，因?yàn)樗鼈兊墓δ芡艿秸{(diào)節(jié)。 細(xì)胞內(nèi)的許多分子過程都是由分子機(jī)器執(zhí)行的，這些分子機(jī)器由許多由其 PPI 組織的蛋白質(zhì)成分構(gòu)建而成。 這些生理相互作用構(gòu)成了所謂的生物體相互作用組學(xué)，而異常的 PPI 是多種聚集相關(guān)疾病的基礎(chǔ)，例如克雅氏病和阿爾茨海默病。

    已通過多種方法從不同的角度對 PPI 進(jìn)行了研究：生物化學(xué)、量子化學(xué)、分子動(dòng)力學(xué)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等。 所有這些信息都有助于創(chuàng)建大型蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)——類似于代謝或遺傳/表觀遺傳網(wǎng)絡(luò)——從而增強(qiáng)當(dāng)前關(guān)于生化級聯(lián)反應(yīng)和疾病分子病因?qū)W的知識，以及發(fā)現(xiàn)具有治療意義的推定蛋白質(zhì)靶點(diǎn)。
隨著研究的深入，科學(xué)家們開始意識到，蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)不僅僅是靜態(tài)的架構(gòu)，而是一個(gè)高度動(dòng)態(tài)、受環(huán)境因素（如pH值、離子濃度、溫度變化及生物節(jié)律）調(diào)控的復(fù)雜系統(tǒng)。這種動(dòng)態(tài)性使得PPI網(wǎng)絡(luò)在細(xì)胞應(yīng)對外界刺激、發(fā)育、分化及疾病進(jìn)展中扮演了核心角色。

     為了更全面地理解PPI的動(dòng)態(tài)特性，新興的技術(shù)如高通量蛋白質(zhì)組學(xué)、單細(xì)胞測序、以及結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)算法的大數(shù)據(jù)分析策略應(yīng)運(yùn)而生。這些技術(shù)不僅能夠揭示特定條件下PPI網(wǎng)絡(luò)的瞬時(shí)狀態(tài)，還能預(yù)測和模擬網(wǎng)絡(luò)在不同生理或病理狀態(tài)下的動(dòng)態(tài)變化。

     針對PPI的干預(yù)策略也成為了藥物研發(fā)的新熱點(diǎn)。通過設(shè)計(jì)小分子抑制劑或肽類藥物，科學(xué)家們旨在精準(zhǔn)地調(diào)控特定的PPI，從而恢復(fù)或增強(qiáng)細(xì)胞功能，治療由異常PPI引起的疾病。例如，針對阿爾茨海默病中tau蛋白聚集的PPI抑制劑的開發(fā)，為延緩該疾病進(jìn)程提供了新的希望。

     蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的研究不僅加深了我們對生命基本過程的理解，也為疾病治療開辟了新途徑。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步和理論的日益完善，我們有理由相信，未來PPI網(wǎng)絡(luò)的研究將引領(lǐng)生物醫(yī)學(xué)進(jìn)入一個(gè)全新的時(shí)代，為人類健康事業(yè)貢獻(xiàn)更多力量。